Фамилия Лудупова — женская форма фамилии Лудупов. Её основа, скорее всего, восходит к бурятскому или калмыцкому личному имени Лудуп. В тибето-монгольской традиции, распространённой у этих народов, имя Лудуп (варианты: Лодой, Лодон) связано с буддийским понятием «праджня» — высшая мудрость, интуитивное знание. Это имя давали мальчикам в буддийских семьях, часто в честь какого-либо ламы или религиозного деятеля.

Модель образования фамилии — классическая для русской адаптации инородных имён: к основе Лудуп добавили русский патронимический суффикс -ов (форма притяжательного прилагательного: «чей?» — Лудупов). Суффикс -а в окончании указывает на женский род. Такая схема массово закрепилась за бурятами и калмыками в XIX — начале XX века, когда при переписях и в документах им «по-русски» оформляли фамилии от отцовских имён.

Географически фамилия Лудупов/Лудупова привязана к территориям традиционного проживания бурят (Республика Бурятия, Забайкальский край, Иркутская область) и калмыков (Республика Калмыкия). Встречается она нечасто, что говорит о её локальном бытовании. В отличие от массовых русских фамилий на -ов, образованных от мирских прозвищ или крестильных имён, бурятские фамилии часто сохраняют прямую связь с буддийским именем-оберегом или именем-посвящением.

Спорных версий происхождения у этой фамилии практически нет: звуковой облик «Лудуп» нехарактерен для славянских, тюркских или финно-угорских корней. Единственное, что можно добавить: в редких случаях фамилию могли записать как Лудупов от русского прозвища «Лудуп» (возможно, искажённое «лудить» — паять, или диалектное «луда» — вид рыбы), но эта версия выглядит натянутой, так как ни одно из этих слов не даёт устойчивой антропонимической модели в Сибири. Поэтому основная и достоверная версия — тибето-монгольское имя с буддийским значением.