Фамилия Луганников — один из тех случаев, когда суффикс подсказывает больше, чем корень. Модель на -ников указывает на происхождение от названия профессии или занятия через промежуточное слово на -ник. То есть сначала было слово «луганник» — так называли человека, а уже потом от этого прозвища образовали фамилию Луганниковы. Суффикс -ов добавляется к основам на согласный, что для русского языка стандартно.

Корень «луг-» прозрачен. Луг — это сенокосное угодье, пойменное или заливное место. Но «луганник» — это не просто «тот, кто живёт у луга». В диалектах русского языка, особенно в южных и центральных губерниях, луганником называли пастуха, который пас скот на общинных лугах, или же человека, арендовавшего луга для покоса. В некоторых местах так могли прозвать крестьянина, чей надел земли находился на сыром, заливном лугу, что считалось не самым удачным для пашни, но выгодным для сенокоса.

Версия происхождения от топонима — от названия населённого пункта вроде Лугань или Луганка — возможна, но менее вероятна для этой модели. Фамилии на -ников редко образуются напрямую от названия места без промежуточного прозвища жителя (например, «луганский» → «луганец» → «Луганец» → «Луганцов»). Здесь же основа «луганник» — это именно прозвище по роду деятельности, а не по месту жительства.

С социальной точки зрения, Луганниковы — это почти наверняка потомки крестьян или однодворцев. В XVIII–XIX веках прозвища по сельскохозяйственным занятиям были массовыми, но фамилии от них закрепились не у всех: требовалось, чтобы прозвище передалось детям и попало в ревизские сказки. Поэтому Луганников — относительно редкая фамилия, не попавшая в число самых частых русских фамилий, но устойчиво встречающаяся в Поволжье и в чернозёмных областях России.