Фамилия Лукоенко звучит как типичная восточноукраинская, и это первое, что бросается в глаза. Её выдает суффикс -енко, который в XVII–XVIII веках был главным маркером формирования фамилий на землях современной Центральной и Восточной Украины. Изначально он означал «маленький» или «сын»: Лукоенко — это буквально «сын Луки» или «малый Лука». Но здесь есть одна важная особенность, которая отличает эту фамилию от, скажем, Лукиенко или Лукашенко.

В основе фамилии лежит не полная форма имени Лука, а его просторечный, разговорный вариант Лукой (или Луконь). В украинской и южнорусской традиции имена часто усекали или смягчали: Лука превращался в Луконю, а от него уже образовывалось прозвище Лукой. Человек по прозвищу Лукой, его сын — Лукоенко. Таким образом, фамилия зафиксировала не церковное, а бытовое, домашнее звучание имени, что указывает на её народное, крестьянское происхождение. Православное имя Лука (от лат. lux — «свет») здесь — лишь отправная точка, а сама фамилия рассказывает о том, как предка звали в повседневной речи.

Вторая, менее вероятная версия, связывает корень с диалектным словом «лук» (оружие) или «лука» (изгиб, излучина реки). Но суффикс -енко в украинской модели прочно привязан к личным именам и прозвищам, образованным от имён. Версия с «луком» или «лукой» дала бы скорее фамилии Луков, Лукин или Лукаш, а не Лукоенко. Поэтому основная гипотеза — патронимическая, от имени Лука через форму Лукой.

Фамилия довольно редкая. По переписям и архивным записям XIX века, Лукоенко встречаются преимущественно в Полтавской и Черниговской губерниях, а также на Слобожанщине (современная Харьковская и Сумская области). Это регионы, где фамилии на -енко были абсолютной нормой среди казаков и крестьян. В России фамилия встречается, но почти всегда как следствие миграции с Украины в XIX–XX веках.

Известных исторических деятелей с этой фамилией в широком доступе нет, что говорит о её «недворянском» происхождении: в реестры записывались в основном простые люди — казаки, мещане, крестьяне. Если ваш предок был Лукоенко, скорее всего, он был из малороссийского сословия, жившего в сельской местности или небольшом городе.