Фамилия Луничкина — женская форма фамилии Луничкин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Луничка. Чтобы понять корень, нужно разобраться, что такое «лун» в русской ономастике.

Самый вероятный источник — слово «лунь». Так на Руси называли хищную птицу семейства ястребиных, обычно светлой, белесой окраски. Прозвище Лунь могли дать человеку с очень светлыми, седыми или белыми волосами, а иногда — с подслеповатыми или «белыми» глазами (как у птицы). От прозвища Лунь образовалась уменьшительная форма Луня, а затем и Луничка. Суффикс -ичк- в данном случае не отчество, а ласкательный или уменьшительный: так могли называть ребёнка или молодого человека, который пошёл в «луня» — в бледного, светловолосого родителя.

Модель образования проста: прозвище Луничка → фамилия Луничкин (чей? — сын или потомок Лунички). Суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному лицу, что типично для русских фамилий XVI–XVII веков, особенно в недворянской среде. Фамилия не аристократическая, а крестьянская или посадская: такие фамилии на -ин часто фиксировались в переписных книгах центральной России и Поволжья.

Есть и менее распространённая, но возможная версия — связь с диалектным словом «лунка» (ямка, впадина, а также лунка в игре в бабки или городки). Человека могли прозвать Луничкой за привычку играть в лунки или за физическую особенность (например, ямочки на щеках). Однако эта гипотеза слабее, так как прозвища от названий игр встречаются реже, чем от внешних признаков, а птичья тема в русских фамилиях (Соколов, Ястребов, Лебедев) — одна из самых массовых.

Географически фамилия Луничкин (и Луничкина) тяготеет к центральным и южным областям России. Встречается она нечасто, что говорит о поздней фиксации или локальном бытовании: возможно, родоначальник жил в одной волости, и прозвище не разошлось широко.

Вероятнее всего, первые носители фамилии были крестьянами или ремесленниками. Никакого отношения к луне или лунному свету фамилия не имеет — это случайное звуковое совпадение с современным словом. Корень здесь чисто русский, народный, из мира живой природы.