Фамилия Лупочкина — женская форма фамилии Лупочкин, и её происхождение ведёт к прозвищу или имени, а точнее — к двум возможным источникам, и оба одинаково правдоподобны.

Первый и самый очевидный: основа «Лупо» — это краткая форма от крестильного имени Лупа (церковное Лупп, латинское lupus — «волк»). Имя было известно на Руси, хотя и нечастым. Если ваш предок звался Лупа, то в быту его могли называть Лупочка — ласково или уменьшительно. Отсюда через суффикс принадлежности -ин (чьим сыном он был?) и родилась фамилия Лупочкин: «сын Лупочки». Типичная для русских фамилий модель, как Петров от Петра.

Вторая версия — прозвищная. В русских говорах слово «лупа» или «лупёж» могло означать нечто, связанное с «лупить»: либо человека, который дерёт лыко (заготовка коры для лаптей), либо драчуна, забияку. В словаре Даля «лупа» — это ещё и «глаз» (от «лупить глаза»), так что прозвище могли дать большеглазому или подслеповатому человеку. Форма «Лупочка» в таком случае — смягчённое прозвище, а фамилия закрепилась за потомками.

Интересна география: эта фамилия почти не встречается в центральных губерниях, её очаги — северо-восток (Вятка, Пермь) и отдельные записи в Рязанской области. В метрических книгах XIX века Лупочкины фиксировались в основном как крестьяне и мещане, без дворянского сословия. Суффикс -кин (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на гласный или мягкий согласный — в данном случае это «Лупочка», что подтверждает разговорное происхождение.

Однокоренные фамилии — Луппов (от полной формы имени Лупп), Лупин, Лупанов — но Лупочкина стоит особняком из-за редкого уменьшительного суффикса -очк-. Это не просто «сын Лупы», а «сын того, кого называли Лупочкой», то есть в основе лежит уже ласкательное внутрисемейное прозвище.