Фамилия Лусенков — наглядный пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Модель на «-енков» — это типичный «двойной» патроним, характерный для южнорусских и отчасти украинских земель. Если фамилии на «-ов» означают «чей?» (сын такого-то), то «-енков» добавляет к этому уменьшительный оттенок: буквально «сын маленького Луси» или «внук Луси». Такие формы активно формировались в XVI–XVII веках в районах современной Белгородской, Курской, Воронежской областей, где оседали служилые люди и крестьяне из Речи Посполитой.

Основа «Лусен-» восходит к имени или прозвищу Луся. Это не самостоятельное каноническое имя, а уменьшительная форма от нескольких крестильных имён: Лука (от лат. «свет»), Лукиан (лат. «светлый»), а реже — от Лукерья (женское имя греческого происхождения, «сладкая»). В быту Луся могло быть и прозвищем: так в некоторых говорах называли человека с лукавым, хитрым взглядом или, наоборот, светловолосого — от «лучина», «лунный свет». Вторая версия менее вероятна, но не исключена для северных территорий, где «лусень» означало «лысый» или «светлый».

Спорных гипотез здесь немного, и все они слабые. Например, связь с рекой Лусой (гидроним в бассейне Днепра) не подтверждается географией фамилии: Лусенковы встречаются в основном в чернозёмной полосе, а не у водоёмов с таким названием. Также маловероятна версия о тюркском корне «лус» — в русской ономастике нет устойчивых заимствований с таким звучанием.

Сословно Лусенковы не были ни княжеским, ни боярским родом. Как и большинство носителей фамилий на «-енков», предки относились к однодворцам или государственным крестьянам. В ревизских сказках XVIII–XIX веков Лусенковы фиксируются в Курской губернии, особенно в Обоянском и Суджанском уездах. К началу XX века фамилия оставалась локальной, без широкого расселения по империи.

Что касается ударения, оно почти всегда падает на второй слог: Лусенкóв. Вариант Лýсенков встречается, но редко — чаще в тех случаях, когда фамилию «обрусели» при переезде в столицы, сменив ударение по аналогии с фамилиями на «-ов» от полных имён.