Фамилия Лущекина — женская форма мужской фамилии Лущекин, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени, связанном с глаголом «лущить». В русских говорах «лущить» означало не только очищать от шелухи (лущить горох, семечки), но и «щелкать орехи», а также «говорить бойко, тараторить». Отсюда и «лущёк» — человек, который быстро и много говорит, или же тот, кто занимается лущением, например, на обмолоте зерна.

Словообразовательная модель здесь простая: основа «лущек-» плюс суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?»). Первоначально Лущекин — это сын Лущека, то есть человека, носившего прозвище Лущек. Суффикс -ек в прозвище мог быть уменьшительным или просто указывать на носителя действия. В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, фамилии на -ин чаще встречаются в северных и центральных регионах России, что даёт примерную географическую привязку: предки носителей фамилии Лущекины могли жить, например, в бывших Новгородской или Вологодской губерниях.

Любопытно, что фамилия Лущекин не связана с украинским или белорусским «лущити» (щелкать семечки) — в тех говорах ударение иное, и форма была бы Лушченко или Лущик. В русском варианте сохранился именно «щёлкающий» звук, характерный для северных и среднерусских диалектов. Таким образом, предок Лущекиных был либо говорливым человеком, либо работником на молотьбе или ореховом промысле — точнее сказать трудно, но оба варианта вписываются в крестьянский быт XVIII–XIX веков.

Фамилия редкая, в списках частотных русских фамилий не встречается, что говорит о её локальном бытовании. Сословно, скорее всего, крестьянская или мещанская: дворянские фамилии на -ин часто образовывались от полных канонических имён (Михайлов, Иванов), а здесь основа — диалектное прозвище, что типично для низших сословий.