Фамилия Лушкова — одна из тех, что образованы от обиходной, «домашней» формы крестильного имени. В основе лежит имя Лушко, которое на Руси было распространённой уменьшительной формой от Лукьян (церковное Лукиан). Само имя Лукьян восходит к латинскому слову lux — «свет», поэтому его нередко толкуют как «светоносный». Святым покровителем имени считается Лукиан Бельгийский, епископ, известный строгой подвижнической жизнью: по преданию, за свои труды он получил дар исцеления недугов и чудотворения.

Модель образования фамилии проста и типична для русского севера и центральных областей. Суффикс -ов- (в женском роде -ова) присоединялся к основе имени или прозвища, отвечая на вопрос «чей?»: Лушко → Лушков, то есть «сын Лушка». По такой же схемы появились тысячи русских фамилий: Иванов, Петров, Сидоров. Однако в случае с Лушковым есть важная особенность: основа на -ко, а не на -ка. В русской ономастике имена и прозвища на -ко (Ивашко, Васько, Лушко) характерны для северных и северо-западных земель, в то время как формы на -ка (Лушка) чаще встречались в южнорусских и украинских говорах. Таким образом, географически фамилия Лушкова скорее всего закрепилась на территории бывших Новгородских или Псковских земель.

Социальный контекст тоже прослеживается. Фамилии, образованные от уменьшительных форм имени, а не от полного церковного, в массе своей принадлежали крестьянам, ремесленникам и посадским людям. В среде дворянства и духовенства такие «домашние» формы почти не встречались — там предпочитали фамилии от полных имён или от географических названий. Поэтому можно с высокой долей уверенности сказать: основатель рода Лушковых был выходцем из рабочей или крестьянской среды, и его потомки со временем закрепили за собой фамилию по имени предка.

Если же отойти от имени Лукьян, существует и альтернативная, хотя и менее вероятная версия. В некоторых говорах «лушок» или «лушка» могли называть человека с каким-то внешним или поведенческим признаком. Но эта гипотеза не подкреплена устойчивой лексической традицией, и основная масса носителей фамилии Лушкова всё-таки восходит к имени Лушко — производному от Лукьяна.