Фамилия Лыскова — женская форма фамилии Лысков. Происхождение у неё неоднозначное, и лингвисты предлагают как минимум три версии, каждая из которых по-своему убедительна.

Самая прямая и распространённая гипотеза — от прозвища Лыско. В русских говорах «лыско» — это ласкательное или пренебрежительное обозначение лысого человека. Корень здесь тот же, что у прилагательного «лысый». Прозвище могли дать человеку с заметной лысиной, выбритой головой или просто с редкими волосами. Суффикс -к- в прозвище характерен для обиходной, сниженной речи, а фамильный суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Лысков, то есть сын или потомок Лыска.

Вторая версия связывает фамилию с украинским прозвищем Лысяк, которое также восходит к слову «лысый». В этом случае фамилия Лысков — русифицированная форма, где украинский суффикс -як заменили на более привычный для великорусских фамилий -ов. Такое переоформление часто случалось при переселении носителей фамилии в центральные губернии России или при записи в ревизские сказки русскими писцами.

Третья версия — топонимическая. Фамилия могла произойти от названия города Лысково в Нижегородской области. Это старинное поселение на правом берегу Волги известно с XV века. Если предки Лысковых были выходцами оттуда, их могли прозвать по месту жительства: «лысковский», а затем фамилия сократилась до формы Лысков. В пользу этой версии говорит то, что фамилия Лысков действительно распространена в Поволжье, особенно в Нижегородской и соседних областях.

Версия о происхождении от «лис» или «лиса» — омонимичная путаница. Слово «лысый» и «лис» в русском языке исторически различались и в произношении, и в написании. Поэтому связывать фамилию с животным стоит только в том случае, если есть документальное подтверждение прозвища Лис (а не Лыс) у конкретного предка. Для массового случая версия с лысиной или городом Лысково выглядит правдоподобнее.