Фамилия Любошенко образована по украинской модели с суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках был распространён в Поднепровье и Слобожанщине. Первоначально такие фамилии означали «сын такого-то» или «потомок», а со временем закрепились как наследственные, не теряя связи с именем или прозвищем отца.

Основой для Любошенко послужило мирское имя Любош. В древнерусской и общеславянской традиции такие имена давали не при крещении, а в быту — чтобы подчеркнуть желанность ребёнка или его характер. Имя Любош напрямую связано с корнем «люб-», то есть «любимый, милый». В старину это был способ пожелать человеку доброй судьбы или закрепить за ним ласковое прозвище. Подобные имена встречаются у многих славянских народов: чешское Любош, польское Любаш, сербское Любиша — все они восходят к той же основе.

Фамилия Любошенко, таким образом, означает «потомок Любоша». Суффикс -енко типичен для центральных и восточных областей Украины, поэтому географически фамилия скорее всего зародилась на территории современной Полтавщины, Черниговщины или Сумщины. Позже, с миграциями, она могла распространиться на юг России и в соседние регионы.

В словообразовательном плане интересно, что между корнем и суффиксом стоит элемент -ш-, который превращает основу в краткую форму имени (Люб-о-ш). Это не отдельное слово, а типичный для славянской антропонимии способ образовать уменьшительное или ласкательное имя: от Люб (как сокращение от Любим, Любомир) путём добавления -ош получается Любош. Такой приём встречается и в других фамилиях — например, Дорошенко (от Дорош), Тимошенко (от Тимош).

Сословно носители фамилии Любошенко относились к разным группам. В реестрах XVIII–XIX веков встречаются как казаки и крестьяне, так и мещане. О дворянском происхождении данных нет, что неудивительно для фамилии на -енко, которая в массе своей оставалась простонародной.

Если сравнивать Любошенко с однокоренными фамилиями, то видны разные модели: Любов (от имени Люб), Любавин (с суффиксом принадлежности -ин), Любский (географическая или топонимическая основа). Любошенко стоит особняком благодаря редкому суффиксу -ош, который не так часто встречается в русских и украинских фамилиях, что делает её более узнаваемой.

Таким образом, фамилия Любошенко — это типичная украинская фамилия-патроним, образованная от ласкового мирского имени Любош со значением «любимый». Она несёт в себе отпечаток семейной истории, где предка звали ласково, а потомки закрепили это прозвище как родовое имя.