Фамилия Любоженко — характерный пример восточноукраинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала доминирующей на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко указывал на «малого», «сына» или «потомка»: Любоженко буквально значит «сын Любожа» или «потомок Любожа». В этом смысле фамилия вписана в ряд таких же прозрачных образований, как Бондаренко, Коваленко или Шевченко, но с той разницей, что основа здесь не ремесленная, а лично-именная.

Основа Любож- восходит к древнерусскому нецерковному имени Любож. Имена с корнем люб- были широко распространены в дохристианской и раннехристианской Руси: Любим, Любава, Любомир, Любож. Они несли положительную характеристику — «любящий», «милый», «желанный». Форма Любож — это, скорее всего, усечённый вариант от двухосновного имени вроде Любожир или Любослав, где вторая часть со временем редуцировалась. Такое имя могли дать ребёнку, которого ждали с особой любовью, или же оно служило прозвищем ласкового, доброго человека.

Географически фамилия Любоженко сосредоточена в центральных и северных областях Украины, особенно в Черкасской, Полтавской и Киевской областях. В России она встречается редко и чаще всего — у потомков переселенцев с Украины времён Столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций XX века. Написание фамилии устойчивое, без вариантов: ударение падает на второй слог — Любóженко, что типично для украинских фамилий на -енко.

В сословном плане носители фамилии, как и большинство обладателей суффикса -енко, были казаками или крестьянами. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано, что тоже типично: украинская старшина редко брала фамилии на -енко, предпочитая польскую модель на -ский. Так что предки современного Любоженко — скорее всего, люди из казацкой или крестьянской среды, жившие в центральной Украине и носившие личное имя Любож, которое со временем закрепилось как родовое прозвище, а затем и фамилия.