Фамилия Лабоженко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели на -енко. Этот суффикс в украинской ономастике выполнял роль отчества или указания на принадлежность к роду: Лабоженко буквально означает «сын Лабожи» или «потомок Лабожи». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в основном у дворянства и духовенства, фамилии на -енко исторически бытовали в среде казачества, крестьянства и мещанства Левобережной и Слободской Украины.

Сложность вызывает основа — Лабожа. В украинском языке нет слова «лабожа» с очевидным значением. Скорее всего, это прозвище, которое дали человеку по поведению или внешности. Наиболее правдоподобная версия связывает его с диалектным глаголом «лабзати» — то есть болтать, говорить без умолку, сплетничать. В некоторых говорах это слово означало и льстить, угождать. Тогда Лабожа — прозвище говорливого, бойкого на язык человека. Менее вероятна связь с «лабода» (лебеда) — такое прозвище могли дать высокому, худощавому человеку, но фонетический переход «д» в «ж» нехарактерен.

Фамилия редкая. Её география — преимущественно центральные и восточные регионы Украины, откуда она могла мигрировать на Кубань и в Ставрополье вместе с переселенцами. В дореволюционных метрических книгах Лабоженко встречаются в Полтавской и Харьковской губерниях. Сословная принадлежность — казаки или государственные крестьяне; дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В русском языке фамилия склоняется как обычное существительное мужского рода: Лабоженко, Лабоженко, Лабоженко — но в бытовой речи её часто не склоняют, воспринимая как неизменяемую украинскую фамилию. Ударение, судя по типовой модели, падает на второй слог: Лабо́женко.