Фамилия Люскин — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается неочевидная основа. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть в основе лежит прозвище или имя Люска. Но что такое «Люска»? Тут возможны два пути, и оба ведут в разные стороны.

Первый и самый вероятный вариант: Люска — это производная форма от крестильного имени Лукьян (от латинского Lucianus — «светлый»). В русской народной традиции Лукьяна могли называть Люк, Люка, а уменьшительно-ласкательные формы давали множество вариантов: Люся, Люська, Люска. Фамилия Люскин, таким образом, — это «сын Люски», то есть потомок человека, которого в обиходе звали Люской. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где -ин активно конкурировал с -ов.

Второй вариант — связь с женским именем Люся (уменьшительное от Людмила, Любовь или даже Люция). В этом случае фамилия образована от прозвища или имени матери: Люскин — «сын Люси». Такие «матронимические» фамилии встречаются реже, но они бытовали, особенно если мать была вдовой или играла ключевую роль в хозяйстве. Однако для Люскина эта версия менее убедительна, так как мужское имя Лукьян даёт более естественную цепочку.

Стоит отметить, что в некоторых говорах «люска» могло быть диалектным словом. Например, в псковских и тверских говорах так называли люльку или колыбель. Но прозвище по такому предмету маловероятно — скорее, это случайное созвучие. Ономастические справочники (например, работы Б. Унбегауна) подтверждают, что фамилии на -ин от уменьшительных форм календарных имён — явление рядовое, и Люскин стоит в одном ряду с Васькиным, Петькиным, Гришкиным.

Географически Люскины встречаются рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что тоже типично для фамилии от распространённого имени. В дореволюционных переписях носители этой фамилии — в основном крестьяне и мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что косвенно подтверждает её «народное» происхождение от просторечной формы Лукьяна.