Фамилия Лыжков образована от прозвища Лыжко по довольно простой и прозрачной модели: к основе на -о добавился стандартный русский суффикс принадлежности -ов, то есть «сын Лыжко». Однако с самой основой всё не так однозначно, и здесь у ономастов есть как минимум две версии.

Первая версия связывает прозвище Лыжко с лыжами. Человек мог получить такое именование, если был охотником, зимой постоянно ходившим на лыжах, или, возможно, мастером, делавшим лыжи. Эта версия вписывается в обширную группу русских прозвищ и фамилий от названий транспортных и перевозочных средств — вроде Лодкина, Санина, Телегина. Вторая версия менее очевидная, но тоже встречается: она возводит основу к глаголу «лгать» или слову «ложь». В этом случае прозвище Лыжко могло указывать на неискренность, хитрость или склонность к обману основателя рода. Из двух гипотез первая — «лыжная» — выглядит правдоподобнее: она более типична для бытовых прозвищ по занятию или предмету, тогда как вторая требует дополнительного фонетического допущения (переход «лг» в «лыж»), который не является стандартным для русских говоров.

Фамилия Лыжков не принадлежит к числу очень частых, но встречается в разных регионах России, что говорит о её достаточно древнем происхождении и бытовании в среде крестьян и охотников. В сословном отношении это типичная крестьянская фамилия: прозвища давали в повседневной жизни, а фамилией они становились при переписях, чаще всего в XVII–XIX веках. Потомок человека по прозвищу Лыжко со временем и стал Лыжковым.