Фамилия Лыжнюк — редкий случай, когда основа прозвища лежит на поверхности, но её прямое значение почти наверняка вводит в заблуждение. Человек, впервые слышащий эту фамилию, обычно думает о лыжах. Однако в славянской ономастике корень «лыж-» чаще всего не связан со спортивным инвентарём, а восходит к диалектному глаголу «лыгать» — то есть лгать, обманывать. Прозвище Лыжня или Лыжун мог получить человек нечестный, склонный к вранью. Суффикс -юк в фамилии Лыжнюк — типично украинский или западнорусский уменьшительный патронимический формант, указывающий на «сына» или «потомка»: Лыжнюк буквально означает «маленький Лыжень» или «сын Лыжня».

Впрочем, у этой версии есть серьёзный конкурент. На западе Украины и в Полесье «лижник» или «лижняк» — это шерстяное одеяло или покрывало, а «лижнювати» означало ткать или валять шерсть. Фамилия могла закрепиться за ткачом или торговцем домоткаными одеялами. Слово «лижник» в этом значении заимствовано из польского или венгерского, и переход «и» в «ы» под влиянием русского произношения дал форму Лыжнюк. Таким образом, предок мог быть не лгуном, а ремесленником, что для крестьянской среды XVIII–XIX веков даже правдоподобнее.

Третья, самая простая версия — прозвище по образу жизни. В говорах «лыжня» — это не только след от лыжи, но и человек, который ходит по глубокому снегу, зимой промышляет в лесу, охотник или лесоруб. В таком случае Лыжнюк — потомок человека, который «лыжничал», то есть жил зимним промыслом. Эта версия слабее, потому что прозвища по действию обычно образуются с суффиксом -ун (Лыжун), а не с -ня.

Географически фамилия сосредоточена на западе Украины — в Ровенской, Волынской, Житомирской областях, а также в приграничных районах Беларуси. Встречаемость крайне низкая, что делает Лыжнюков носителями локального прозвища, которое не успело широко разойтись. В дореволюционных ревизских сказках эта фамилия практически не фиксируется, что указывает на её позднее оформление — скорее всего, в конце XIX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии по прозвищам.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лыжников, Лыжин, Лыжов — показывает, что модель на -юк стоит особняком. Если Лыжников — это явный «сын лыжника» (человека, делавшего лыжи или ходившего на них), то Лыжнюк — украинский вариант с тем же корнем, но с другим значением. Наиболее вероятно, что основа — диалектное «лыжный» в значении «лживый», и фамилия несёт в себе нелестную характеристику предка. Однако без точной записи из метрической книги конкретной семьи нельзя исключить ни ремесленную, ни охотничью версию.