Фамилия Мачкините с первого взгляда кажется необычной для русского уха. Всё дело в её происхождении: это литовская фамилия, и её окончание -ите (-ytė) — верный признак женского рода в литовской антропонимике. В Литве фамилии жён и незамужних дочерей образуются от фамилии отца с помощью разных суффиксов: для дочерей — как раз -ytė, -iūtė или -utė. Таким образом, Мачкините — это «дочь Мачкинаса» или «женщина из рода Мачкинов». Мужская форма фамилии, скорее всего, звучит как Мачкинас (Mačkinas).

Корень фамилии — Мачк- — восходит к литовскому личному имени или прозвищу. Самое вероятное объяснение: от слова mаčkius или mаčkė — «кошка», «кот». В литовском языке это слово звучит как mаčkė (диалектное), а в некоторых говорах так называли не только животное, но и человека с кошачьей повадкой — хитроватого, ловкого или ласкового. Прозвище Мачка (или Мачкинас) мог получить человек, которого за глаза сравнивали с котом. Менее распространённая версия связывает корень с балтским mak- («мокрый», «сырой»), но она слабее: в фамилиях животных прозвища встречаются гораздо чаще, чем топографические.

Фамилия Мачкините — редкая даже для Литвы. Встречается она преимущественно в северо-восточных регионах страны, особенно вокруг Паневежиса и Укмерге. В России или Беларуси эта фамилия — почти всегда следствие миграции литовцев в XIX–XX веках, когда многие семьи переезжали в центральные губернии или Сибирь. Из-за окончания -ите русские чиновники часто путали её с польскими или белорусскими фамилиями на -ич, но это ошибка: литовская модель образования совершенно иная.

Если сравнить Мачкините с однокоренными фамилиями, то в польском языке есть Мачкевич (Mackiewicz), а в белорусском — Мачко и Мачков. Все они образованы от того же прозвища «кот», но с разными суффиксами, характерными для каждой языковой традиции. Литовская версия сохранила самый архаичный способ — указание на пол и родство, что делает её особенно ценной для историков языка.