Фамилия Маглали — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Скорее всего, перед нами не славянская и не тюркская фамилия в привычном понимании, а грузинская или имеющая прямое отношение к Кавказу.

Разбираем основу. В грузинском языке слово «магла» (მაგლა) означает «туман» или «мгла». Соответственно, Маглали — это тот, кто связан с туманом, живёт в туманной местности, или же прозвище угрюмого, «пасмурного» человека. Грузинские фамилии часто образуются с помощью суффиксов принадлежности (-дзе, -швили, -иа, -ава и другие), но окончание «-ли» встречается, например, в мегрельских и некоторых других западно-грузинских фамилиях (сравните: Квирквелия, Чхеидзе — другой тип, но суффикс -ли есть в основах). Впрочем, Маглали может быть и формой прилагательного: «туманный».

Менее вероятная, но возможная версия — тюркская. В тюркских языках есть корень «маг» (сила, могущество) или «магал» (область, округ). Однако окончание «-ли» в тюркских языках — типичный аффикс обладания: «имеющий что-то». Например, «магалли» — «имеющий область»? Но такое толкование выглядит натянутым, тем более что для тюркских фамилий более характерны окончания -ов, -ев, -оглы.

Обратите внимание на написание: двойное «л» в середине (Маглали) — редкая черта для русского языка. В грузинском же удвоение согласных на письме обычное дело и отражает произношение. Если бы фамилия была русифицированной, её скорее записали бы как Маглалов или Маглаев. Сохранение исконного окончания «-и» и двойной «л» — сильный аргумент в пользу того, что предки носителя фамилии были выходцами из Грузии или соседних регионов (Абхазия, Аджария), где такие модели фамилий естественны.

Таким образом, с высокой долей уверенности можно сказать: фамилия Маглали происходит от грузинского слова «туман» и указывает либо на место жительства предка (в туманной долине, у подножия гор, где часто стоит мгла), либо на его внешнюю суровость и немногословность.