Фамилия Макачирова — женская форма от Макачиров, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Макачир. Основа здесь — тюркское слово «макачыр» (варианты: макачи, макач). В ряде тюркских языков (татарском, башкирском, казахском) «макач» означает «козёл» или «козлёнок». «-ыр» — характерный для тюркских языков словообразовательный суффикс, часто образующий названия профессий или лиц по характерному признаку. Таким образом, Макачир — это, скорее всего, прозвище пастуха, бойкого или упрямого человека, которому приписывали «козлиные» черты: упрямство, резвость, драчливость.

Русский суффикс «-ов» (в мужской форме Макачиров) указывает на принадлежность: «чей?» — Макачиров, то есть сын или потомок Макачира. Такая модель фамилий — тюркская основа плюс русский патронимический суффикс — типична для Поволжья и Приуралья, особенно среди татар, башкир, мишарей, принявших православие, или русских, долго живших в тюркоязычном окружении. Фамилия Макачирова почти наверняка имеет корни в этих регионах: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской, Челябинской или Самарской областях.

Встречается и более редкая, но возможная версия: от диалектного русского слова «макач» — так в некоторых говорах называли пройдоху или ловкача. Однако тюркская этимология убедительнее: она объясняет и суффикс «-ыр», и географию бытования фамилии. В современных базах данных Макачировы встречаются редко, что подтверждает её локальный, а не массовый характер. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, жившими на стыке русской и тюркской культур.