Фамилия Макаганчук — один из вариантов распространённой восточнославянской фамилии, в основе которой лежит прозвище Макогон. Восходит оно к двум словам: «мак» и «гнать». Макогоном называли того, кто занимался выжимкой макового масла — «гнал мак». Это типичное «профессиональное» прозвище, которое указывало на конкретное ремесло предка.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Макогон добавлен суффикс -чук, характерный для украинской и белорусской ономастики. Этот патронимический суффикс указывал на принадлежность к роду — «сын Макогона» или «потомок Макогона». Фамилии с такой моделью особенно часты на западе Украины и в южных регионах Белоруссии, где суффикс -чук конкурировал с более северным -ов/-ев и польским -ский.

Особенность написания «Макаганчук» вместо ожидаемого «Макогончук» — результат живого фонетического процесса. В безударном положении гласный «о» в корне редуцировался до «а», и это произносительное изменение закрепилось в письменной форме. Такое явление — аканье — типично для юго-восточных говоров украинского языка и для некоторых белорусских диалектов, поэтому не стоит считать его ошибкой: это отражение реального звучания фамилии в той среде, где она бытовала.

Само прозвище Макогон со временем полностью вытеснило исходное личное имя, став наследственным. В документах XVII–XVIII веков на территории Речи Посполитой встречаются как Макогоны, так и их потомки с суффиксальными фамилиями, но конкретные архивные записи по Макаганчукам пока не введены в широкий научный оборот. Можно предположить, что предки носителей этой фамилии жили в сёлах западных областей Украины, где мак выращивали не только для еды, но и для получения масла — продукта, ценившегося в постные дни.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Макагон, Макагоненко, Макагонюк) показывает, что все они отталкиваются от одного прозвища, но различаются региональными суффиксами. Макаганчук — один из наименее частых вариантов, что делает его интересным для локальной генеалогии.