Фамилия Махмудахунов отвечает на вопрос «чей вы будете?» — это типичная русская модель образования от отчества, где к восточному имени добавили русский суффикс -ов. Потомка человека по имени Махмудахун так и записали в документах: Махмудахунов, то есть сын Махмудахуна.

Само имя Махмудахун составное, и в нем соединились два пласта восточной культуры. Первая часть восходит к арабскому Махмуд, что значит «прославленный, достойный похвалы». Вторая часть — персидское Ахун. В тюркской среде ахуном называли не просто учителя, а наставника, который ведет людей по верному пути, человека близкого и уважаемого. Складываясь, эти две части дают имя со смыслом «прославленный учитель» или «достойный похвалы наставник».

Обратите внимание на стык частей: в имени Махмудахун конечный звук первой основы и начальный звук второй слились воедино, поэтому при разборе легко ошибиться и принять Ахун за самостоятельную часть. На деле это цельное имя, которое в тюркских языках бытовало как почтительное обращение к уважаемому человеку, часто связанному с религиозным знанием или ученостью.

Такие двусоставные имена с элементом «ахун» встречались в Средней Азии и среди тюркских народов, где персидская лексика была привычной частью языка. Фамилия же закрепилась уже в русской среде, когда носителей такого имени стали записывать по отцу. Судя по форме, фамилия относительно поздняя: она возникла не раньше конца XIX — начала XX века, когда массовые переписи и паспортизация затронули окраины империи.

Стоит сказать и о том, что фамилия редкая и несет явный отпечаток региона, где тюркские и персидские традиции переплелись. Встречаются и варианты написания — Махмудахонов, — но исходная форма с «у» точнее передает звучание имени-основы.