Фамилия Махусаев образована от имени Махусай. Предположительно, оно представляет собой искаженное бурятское имя Мунхэзая, которое в переводе означает «вечная судьба». Таким образом, человек, предка которого звали Махусай, со временем получил фамилию Махусаев. Так, в Книге памяти Иркутской области упоминаются буряты Махусаев Исаак Иванович, который родился в 1911 году (Иркутская обл., Аларский айм., Мальхитуй улус), и Махусаев Фома Филимонович, рожденный в 1892 году там же.