Фамилия Маклюшкин образована от прозвища Маклюшка. В её основе лежит глагол «маклачить» — В. И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет его как «сводить продавца с покупателем». Скорее всего, первый носитель прозвища был перекупщиком или посредником при сделках — человеком, который сводил продавца и покупателя за долю прибыли. Такие «профессиональные» именования были распространены в среде торговцев и ремесленников: прозвище быстро приживалось, если занятие было заметным или неоднозначным в глазах окружающих.

Есть и вторая версия, которая связывает Маклюшку с существительным «маклак» — «большая кость». В этом случае прозвище давали по внешнему признаку: либо крупному, ширококостному человеку, либо, наоборот, худощавому, у которого кости выступали. Такие прозвища по телосложению — одни из самых древних в русской антропонимии. Какая из двух версий вернее для конкретной семьи, сказать сложно, но первая — «профессиональная» — подкреплена словарной фиксацией и логикой бытового именования: маклачество было заметным промыслом, и прозвище могло закрепиться за родом занятий.

Фамилия оформлена по стандартной модели на -ин: от основы на -а (-я) образуется притяжательное прилагательное, которое затем становится фамилией. Маклюшка → Маклюшкин — буквально «сын Маклюшки». Такая модель характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать корни в тех регионах, где была развита торговля и перепродажа — например, в Поволжье или на северо-западе.

Среди однокоренных фамилий — Маклаков, Маклачков, Маклюков. Все они восходят к тому же гнезду «маклак» / «маклачить». Фамилия Маклюшкин — одна из редких, она не входит в списки массовых русских фамилий, что может указывать на локальное бытование или небольшой род.