Фамилия Маколюнас (фонетический вариант Макалюнас) образована от прозвища Маколе (Макале). Вероятно, оно восходит к латышскому слову makaulė - «башка; макушка». Так могли называть человека с большой головой или же умного, сообразительного. Согласно другой версии, в основе этой фамилии лежит прозвище Макаль, которое ведет свое начало от глагола «макать» - «окунать, опускать в жидкость и вынимать; погружать, потоплять и снова вытаскивать». Вероятно, прозвище Макаль относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься вымачиванием льна или же изготовлением маканых свечей.