Фамилия Макотрина — женская форма мужской фамилии Макотрин, которая образована по стандартной восточнославянской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Макотрин означает «сын или потомок Макотары» (или «человек из семьи Макотары»). Основа фамилии — прозвище Макотра, которое и дало начало всему роду.

Слово «макотра» (или «макотерть») в русских говорах означало глиняную посуду — широкую чашу или горшок для растирания мака, табака или других сыпучих веществ. Прозвище Макотра могли дать гончару, делавшему такую утварь, либо человеку с круглой, полной фигурой, напоминающей этот сосуд. В некоторых диалектах «макотра» также имела переносное значение — медлительный или неповоротливый человек, что тоже могло стать основой для прозвища.

С точки зрения словообразования, фамилия Макотрина — редкий случай, когда основа не является распространённым личным именем или названием профессии, а отсылает к конкретному бытовому предмету. Это сближает её с фамилиями вроде Горшков или Кувшинов, но в отличие от них, Макотрин имеет более узкую региональную привязку: прозвище бытовало преимущественно в южнорусских и украинских говорах, где слово «макотра» было в ходу.

Исторически фамилия могла принадлежать крестьянским или ремесленным семьям. Встречается она нечасто, что объясняется локальным характером прозвища. В письменных источниках, например, в переписных книгах XVII века, можно найти упоминания людей с прозвищем Макотерть или Макотра, но систематических списков носителей фамилии Макотрин до XIX века нет — она оставалась в рамках устной традиции.