Фамилия Маковников — одна из тех, что прямо указывают на род занятий. Её основа — не имя и не прозвище, а профессия: маковник. В русских говорах так называли того, кто торговал маком или изготавливал маковое печенье, пряники, халву. В словаре Даля «маковник» — это и торговец маком, и сорт пряничного изделия. Соответственно, предок носителя фамилии мог печь маковые пряники на продажу или держать лавку с маком и маковыми сладостями.

Суффикс -ов- в фамилии Маковников стоит дважды, и это неслучайно. Модель образования здесь сложнее, чем у рядовых «профессиональных» фамилий вроде Кузнецов. Сначала от слова «маковник» образовалось отчество Маковников — «сын Маковника». Такая двойная суффиксация (-ник + -ов) встречается реже, чем одинарная, и говорит о том, что прозвание закрепилось за родом прочно: отца уже звали не по имени, а по ремеслу, и сына записали как «Маковникова».

Интересно, что у этой фамилии есть «двойники» с тем же корнем, но разной суффиксацией: Маков, Маковецкий, Макухин. Маковников стоит особняком — он недвусмысленно отсылает к конкретному ремесленнику, а не к владельцу макового поля или человеку с прозвищем Мак. Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, где мак был привычной культурой и шёл в пищу, а не только на аптечные снадобья.

В документах фамилия встречается с XVIII века, в основном в купеческой и мещанской среде — то есть среди городских торговцев и ремесленников. Дворянских родов Маковниковых не зафиксировано, что логично: профессия пряничника или торговца маком не давала привилегий. Зато у фамилии есть характерная примета — она почти не искажалась в написании, в отличие от многих народных фамилий, прошедших через канцелярскую переделку. Маковников и есть Маковников, без вариантов вроде «Макавников» или «Маковникова» (в мужском роде).