Фамилия Маленченкова — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве исходной для словарной статьи, хотя исторически фамилия образована от мужского прозвища или имени. Основа здесь — «Маленч» или «Маленко», а суффикс «-енков» указывает на патронимическую модель: «чей?» — Маленченков, то есть сын или потомок человека по прозвищу Маленок.

Самая вероятная версия происхождения — от прилагательного «малый» (маленький). В древнерусских говорах «маленок» — это не только ребёнок, но и младший сын в семье, парень небольшого роста или просто человек, которого так прозвали за скромность или юный вид. В ономастике известна модель: от «малый» через суффикс «-енк(о)» образовывали уменьшительно-ласкательные прозвища, характерные для южнорусских и украинских земель. Суффикс «-енков» в фамилии — типичный для русской адаптации украинских или белорусских прозвищ на «-енко»: переселенец с Украины или из Белоруссии получал фамилию Маленченков, а его жена или дочь записывалась как Маленченкова.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с диалектным словом «маленка» (мельница) в некоторых говорах. Тогда прозвище Маленок мог получить мельник или человек, живший у мельницы. Однако эта версия слабее: суффикс «-енк(о)» редко образует прозвища от названий строений, а чаще — от личных имён или качеств.

В современных справочниках фамилия Маленченкова встречается редко, преимущественно в центральных и южных регионах России, а также в областях, куда в XVIII–XIX веках переселялись крестьяне с Украины (Курская, Воронежская, Ростовская области). Сословно носители фамилии относились к крестьянству или мещанству — никаких дворянских корней в этом патрониме нет.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Маленченков стоит в одном ряду с Маленковым, Маленко, Маленкиным. Разница в суффиксах: «-ов» — более северная форма, «-енков» выдаёт южное происхождение предка, а «-ин» мог возникнуть от прозвища Маленя. Так что по фамилии Маленченкова можно довольно уверенно сказать, что предок носителя жил в чернозёмной полосе или на Слобожанщине и носил прозвище Маленок — скорее всего, за малый рост или младшее положение в семье.