Фамилия Малиненковы — один из тех случаев, когда фамилия прошла через две языковые среды и сохранила следы этого пути в своей форме. В её основе лежит прозвище Малина, которое образовано напрямую от названия ягоды. Такие «растительные» прозвища были распространены у славян ещё в дохристианскую эпоху: называя ребёнка Малиной, родители как бы поручали его природе, надеясь, что он перенят у растения силу, сладость или пользу. Не исключено и чисто бытовое, ласковое обращение — малиной могли называть любимого ребёнка.

Самое интересное в фамилии — не корень, а суффиксальная конструкция. Судя по суффиксу -енк-, фамилия первоначально имела вид Малиненко и сформировалась на территории Украины или Белоруссии. Там суффикс -енко указывал на принадлежность: Малиненко — «сын Малины» или «потомок того, кого звали Малина». Позже, когда носители фамилии переселились в великорусские земли, фамилию «обрусили»: к основе Малиненко добавили типичный русский суффикс -ов, получив Малиненков. Такая двойная суффиксация — не редкость для фамилий, которые переходили из одной славянской традиции в другую, и она прямо указывает на миграцию семьи с юго-запада в центральную Россию.

В документах фамилия зафиксирована, например, в Книге памяти Смоленской области: там упомянут колхозник Малиненков Фёдор Никанорович, 1890 года рождения, из деревни Хохловка Екимовичского района. Это подтверждает, что к XIX — началу XX века фамилия уже прочно обосновалась в смоленских землях.

Коротко: Малиненковы — это потомки человека, которого в семье ласково называли Малиной. Фамилия прошла путь от украинско-белорусского Малиненко до русского Малиненков, и сама её форма — живое свидетельство этого переселения.