Фамилия Малковский образована от имени собственного и относится к распространенному типу украинских фамилий. Основой фамилии Малковский послужило мирское имя Малко. Фамилия Малковский, скорее всего, образована от распространённого в старину мирского имени Малко с основой «мал-» - «маленький». В семьях маленького, самого младшего ребенка часто называли просто Мальцом, Малютой, Малышом, Малко. И даже когда ребёнок становился взрослым, он по-прежнему носил детское имя Малко, которое впоследствии закрепилось в фамилии. Согласно другой гипотезе, фамилия Малковский восходит к прозвищу Малко, которое указывало на особенности внешности человека, а именно — на невысокий рост. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Малко, со временем получил фамилию Малковский. О точном месте и времени возникновения фамилии Малковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Малковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.