Фамилия Малойван была образована слиянием двух основ: «малый» и «Иван», то есть «младший Иван». Добавочное определение к этому имени было естественным, так как в прошлом его носили 25% русских крестьян. Нередки были семьи, где все сыновья были Иваны. Однако, скорее всего, имя Иван исторически восходит к каноническому мужскому личному имени Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Малым же могли прозвать младшего ребенка в семье, либо невысокого и худенького человека.