Фамилия Мальтисова — женская форма фамилии Мальтисов, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В русской ономастике суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Мальтисов — это сын или потомок человека по прозвищу Мальтис. Само прозвище Мальтис — редкое, и его корень, скорее всего, не славянский. Наиболее вероятная версия связывает его с немецкой или прибалтийской фамилией Maltis, которая могла попасть в Россию вместе с переселенцами, ремесленниками или военными специалистами в XVIII–XIX веках. В немецком языке основа может восходить к слову «Malz» (солод) — прозвище солодовника, пивовара, или к личному имени с корнем «malt» (старонемецкое «сильный», «могучий»). В прибалтийских языках (литовском, латышском) существует фамилия Miltis, означающая «мука», что тоже указывает на занятие, связанное с помолом или выпечкой.

Вторая, менее распространённая версия — искусственное происхождение. В семинарской среде фамилии нередко давали по латинским или греческим словам. «Maltis» могло быть образовано от латинского «maltum» (солод) или даже от греческого «melitos» (медовый), но такие случаи единичны и требуют документального подтверждения для конкретной семьи.

Географически фамилия Мальтисов (и Мальтисова) встречается крайне редко, её очаги — Псковская область, Ленинградская область и Прибалтика, что косвенно подтверждает связь с немецко-прибалтийским влиянием. По сословной принадлежности носители могли быть мещанами, купцами или обрусевшими немцами. Версия о происхождении от слова «мальтиец» (житель Мальты) маловероятна — для этого в русском языке существовала бы форма «Мальтийский» или «Мальтийцев». Таким образом, фамилия Мальтисова — скорее всего, след миграции и адаптации западноевропейского прозвища на русской почве, где редкий корень сохранился почти без изменений.