Фамилия Мамойкина — женская форма, а мужская, Мамойкин, образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность, родство: Мамойкин буквально означал «сын (или человек) Мамойки». Исходное имя или прозвище Мамойка и есть ключ к происхождению фамилии.

Само прозвище Мамойка звучит необычно и сразу вызывает вопросы. Наиболее вероятная версия связывает его с диалектным словом «мамойка» — так в некоторых русских говорах (особенно в северных и сибирских) называли ласково мать, маму, а иногда и просто добрую, заботливую женщину. В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком, который был особенно привязан к матери, или за тем, кого так в шутку называли соседи. Менее распространённая, но тоже возможная гипотеза — связь с тюркским именем Мамай (от арабского «мамун» — «надёжный, хранимый»). В таком случае Мамойка — это уменьшительно-ласкательная форма от Мамай, а фамилия указывает на потомка человека с таким именем. Однако для фамилии Мамойкина тюркский след менее вероятен: суффикс -ин в сочетании с окончанием -ка типичен именно для русской народной традиции образования прозвищ от родственных терминов.

Фамилия редкая и географически привязана преимущественно к центральным и северным регионам России. Встречается она в основном в бывших вотчинах и сёлах, где велась подробная подушная перепись, — в Ярославской, Костромской, Вологодской областях. Это косвенно подтверждает версию о диалектном, «материнском» происхождении: именно в этих краях слово «мамойка» было в ходу.

Таким образом, носительница фамилии Мамойкина может считать, что её предок получил прозвище по материнской линии — либо как «маменькин сынок» (в добром, бытовом смысле), либо как человек, которого в деревне ласково называли «мамойка» за мягкий или заботливый нрав. Фамилия ставит акцент не на профессию или внешность, а на родственные и человеческие отношения, что для русских фамилий встречается реже, чем прозвища по ремеслу или отцу.