Фамилия Манчуленко звучит почти как иностранная, но на самом деле это украинская фамилия, образованная по классической для южнорусских земель модели. Её основа — Манчуло, а суффикс -енко указывает на то, что перед нами потомок человека с таким именем или прозвищем. На Украине и в Белоруссии фамилии на -енко давали детям, подчёркивая родство: буквально «Манчулёнок», то есть «сын Манчулы».

Корень фамилии — «Манч-» — восходит к уменьшительной форме крестильного имени Мануил (от древнееврейского Иммануил — «с нами Бог»). В народной речи имя Мануил сокращали до Мануйло, а затем до Манчо, Манчук, Манчула. Форма Манчула — это ласкательное или просторечное обращение, характерное для украинского и белорусского языков. Соответственно, Манчуленко — это «внук» или «сын Манчулы».

Есть и другая, менее вероятная версия. В польских и украинских говорах слово «манчула» могло означать человека с крупными руками или неуклюжего, неловкого. Однако большинство ономастов (в том числе исследователи украинских фамилий) склоняются к версии от имени Мануил, потому что прозвищная версия не подкреплена широкой документальной базой.

Географически фамилия Манчуленко привязана к центральной и восточной Украине — Черкасской, Полтавской, Киевской областям. В России она встречается реже, в основном в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселялись украинские крестьяне в XIX веке. В переписях и ревизских сказках XVIII–XIX веков фамилия фиксируется именно в этих регионах, что подтверждает её «малороссийское» происхождение.

В отличие от многих фамилий на -енко, которые со временем теряли связь с исходным именем, Манчуленко сохранила редкую основу. Мануил — имя не слишком частое, поэтому его производные в фамилиях встречаются реже, чем, скажем, Ивановичи или Степаненко. Это делает фамилию заметной и достаточно узнаваемой в украинском ономастиконе.