Фамилия Манидаров — редкий случай, когда иноязычная основа настолько плотно срослась с русским суффиксом, что почти не оставляет сомнений в способе своего появления. Перед нами типичная «кавказская» модель: тюркское или иранское имя-прозвище плюс русский патронимический суффикс -ов. В русских фамилиях суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Манидара), а значит, основу Манидар следует искать в личном имени или прозвище.

Скорее всего, в основе лежит арабо-персидское имя Манидар, которое распространено у народов, исповедующих ислам. Имя составное: «мани» (смысл, значение) и «дар» (имеющий, обладающий). В сумме — «обладающий смыслом», «значащий», «полный значения». Возможен и другой вариант: «мани» как «жемчуг» (перс.) — тогда «жемчугоносный». Оба толкования — именные, с положительной семантикой, что типично для мусульманского именослова.

Фамилия Манидаров могла возникнуть у лезгин, азербайджанцев или татов — народов, где имя Манидар встречается чаще всего. Русский суффикс -ов добавился при русификации документации в XIX–XX веках, когда представителям кавказских народов массово записывали фамилии по русскому образцу. То есть носитель фамилии — потомок человека по имени Манидар, а сама фамилия — калька с отчества.

Встречается фамилия редко, сосредоточена в Дагестане, Азербайджане и среди мигрантских общин в крупных городах России. Вариантов написания немного, так как имя Манидар не имеет устойчивого тюркского варианта с «глухими» согласными. Фамилия не крестьянская и не дворянская в классическом русском смысле — она поздняя, канцелярская, что делает её хорошим маркером этнической и семейной истории её носителей.