Фамилия Манушариди — редкий пример фамилии, образованной от грузинского или греческого имени с явным восточным колоритом. Её основа — мужское имя Манушар, которое восходит к персидскому «Манучехр» (в переводе — «райский лик» или «небесное лицо»). В грузинской традиции имя Манучар (или Манушар) было известно с древности, его носили представители знати, в том числе из рода князей Дадиани. Фамилия Манушариди, скорее всего, сложилась по греческой модели с суффиксом -иди, который указывает на происхождение от отца (буквально «сын Манушара»). Встречается она преимущественно у понтийских греков, а также у греков, переселившихся из Грузии и Причерноморья в Россию и на Украину в XIX–XX веках.

Суффикс -иди (в русской передаче часто -иди или -идис) типичен для греческих фамилий и даёт чёткую подсказку: носитель фамилии — потомок человека по имени Манушар. Если бы фамилия осталась в грузинской среде, она звучала бы как Манучаришвили или Манучаридзе. Переход имени в греческую модель говорит о том, что предок мог быть греком, жившим в Грузии, или понтийцем, воспринявшим местное имя. Встречаются и варианты написания — Манучариди, Манушаридзе (как гибридная форма), но Манушариди — наиболее устойчивый вариант в русскоязычных документах.

Географически фамилия привязана к регионам, где селились понтийские греки: Краснодарский край, Ставрополье, Абхазия, а также к греческим общинам в Греции и на Кипре. В России носителей немного, фамилия не входит в списки распространённых. Социальный статус предков определить сложно: имя Манушар само по себе не указывает на знатность, но в грузинской среде оно было аристократическим, а у греков могло встречаться и у крестьян, и у купцов. Единственное, что можно утверждать с уверенностью: фамилия образована от имени, а не от прозвища или ремесла, и её корень — восточного происхождения, что необычно для греческой ономастики.

Если сравнивать с однокоренными, то в русском языке есть фамилия Манушаров (с типичным русским суффиксом -ов), но она ещё реже. Манушариди — более архаичная и этнически окрашенная форма, сохранившая связь с греческой диаспорой. Споров о происхождении здесь почти нет: лингвисты единодушны в том, что основа — личное имя, а суффикс — греческий патронимический.