Фамилия Манушенков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Манушенков послужило церковное имя Иммануил. Вероятно, Мануша — производная форма имени Иммануил, которое в переводе с древнееврейского означает «с нами Бог». Очевидно, основатель рода Манушиных был человеком из простого сословия. Согласно другой версии, в основе фамилии Манушенков лежит прозвище Мануша, которое образовано от слова «манить» - «звать лестью, посулами», «дразнить, обманывать», «ждать, дожидаться», «мешкать, медлить». Так, основатель рода Манушиных мог быть охотником, подманивающим зверя. Скорее всего, фамилия Манушенков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Со временем, вероятно, род Манушенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мануша, со временем получил фамилию Манушенков. О точном месте и времени возникновения фамилии Манушенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Манушенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.