Фамилия Маоквий — редчайший случай в русской ономастике. На первый взгляд, она выглядит как искусственное или заимствованное образование, не вписывающееся в привычные модели русских фамилий (на -ов, -ин, -ский). Однако при детальном разборе обнаруживается вполне логичная, хоть и нетипичная, словообразовательная цепочка.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Маоква. В русских говорах слово «маоква» могло означать нечто влажное, сырое или топкое — от диалектного «маять» (мочить, пачкать) или «макнуть» (окунуть). В таком случае прозвище давали человеку, который жил у болота, работал с водой (например, рыбак или бондарь) или просто отличался неаккуратностью. Суффикс -ий в фамилии Маоквий выполняет роль притяжательного окончания, характерного для полных прилагательных в древнерусском языке: «чей?» — Маоквий, то есть «сын того, кого звали Маоква». Эта модель (основа на -а + -ий) встречается редко, но известна по фамилиям вроде Скорняков — Скорнячий, хотя там суффикс другой.

Географически фамилия могла закрепиться в северных или центральных областях России, где диалектное слово «маоква» бытовало. Второй, более спорный вариант — происхождение от личного имени Маоквий как варианта канонического имени Маврикий (лат. Mauricius — «мавританский»). В просторечии имя могли переделать в Маоквий, отбросив слог «ри», а фамилия образовалась по модели «чей?» — Маоквий (сын Маоквия). Это объясняет необычное окончание, но требует допущения, что имя было широко распространено, чего исторические источники не подтверждают.

Точных сведений о сословной принадлежности носителей фамилии нет. Ввиду редкости и нестандартной формы, Маоквий могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвища часто фиксировались в документах без типовых суффиксов. Современные носители фамилии — единицы, и их генеалогия, скорее всего, ведет к одному небольшому роду из конкретной местности.