Фамилия Марафеев — одна из тех, где с первого взгляда ясна модель образования, но корень заставляет задуматься. Формально это типичная русская фамилия на -ев, то есть притяжательное прилагательное, отвечавшее на вопрос «чей?» и указывавшее на сына или потомка человека по имени или прозвищу Марафей. Вопрос в том, откуда взялось само это имя.

Самая прямая и правдоподобная версия — диалектное или искажённое произношение канонического крестильного имени Малафей. В православных святцах есть имя Малахия (в русской народной традиции — Малафей, Малафейка). Церковная форма через «о» или «а» в просторечии легко переходила в «Марафей» — из-за аканья, когда безударное «о» или «а» звучало неотчётливо, а потом закрепилось на письме. Подобные переходы хорошо известны: от Малафея произошли фамилии Малафеев, Малафейкин, а Марафеев — их фонетический «родственник».

Менее вероятна, но не исключена связь с греческим словом «марафон» или с именем Марафон, которое в античной истории известно, но в русском именослове практически не встречалось. Единичные случаи могли возникнуть у духовенства: семинаристам иногда давали фамилии по античным именам и географическим названиям. Однако для фамилии Марафеев это скорее экзотика, чем правило. Основная масса носителей — потомки крестьян или мещан, а не выпускников семинарий.

По географии фамилия редкая, встречается в центральных и южных областях России, где аканье было особенно сильным. Социальный состав предков, судя по типу суффикса, — непривилегированные сословия: в среде дворянства и купечества такие «простые» отчества на -ев были редкостью, чаще там использовали фамилии на -ский или более книжные формы.

Итог простой: ваш предок, скорее всего, носил имя или прозвище Марафей, которое является народным вариантом церковного имени Малафей (Малахия). Фамилия не несёт в себе указания на ремесло или занятие — она чисто патронимическая, от личного имени.