Фамилия Мариненкова хранит память о редком крестильном имени Марин. В переводе с латинского «marinus» означает «морской». В святцах известно несколько носителей этого имени: мученик Марин (день памяти 30 марта), праведный Марин (16 апреля) и преподобный Марин (15 июня). Скорее всего, основатель рода Мариненковых был человеком высокого социального статуса — имя Марин носили нечасто, и фамилия от него указывала на уважение к предку.

Менее вероятная гипотеза связывает фамилию с женским именем Марина (тоже «морская»). Но фамилии, образованные от женских имён, на Руси были редкостью, поэтому эта версия уступает первой.

Словообразовательная модель здесь двойная. Сначала появилась украинская или белорусская фамилия Мариненко: суффикс -енко указывал на сына или потомка («сын Марина»). Позже, когда род переехал в Россию, фамилию русифицировали, добавив суффикс -ов. Так Мариненко превратился в Мариненкова — по правилам русской грамматики, фамилия стала склоняться как прилагательное.

Особенность фамилии — её редкость. В отличие от массовых Ивановых или Петровых, Мариненковы встречаются нечасто, а значит, носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких близких родов. Сегодня фамилия бытует в форме Мариненков (мужская) и Мариненкова (женская), причём женский вариант стал основным в быту, хотя исторически он вторичен.