Фамилия Марисая — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от массовых фамилий на -ов и -ин, эта имеет нерусский облик и, скорее всего, связана с прибалтийским или финно-угорским миром. Основа «Марис» — это, вероятнее всего, вариант имени Марис, которое широко распространено в Латвии и Эстонии. В этих языках Марис — форма христианского имени Марий (от латинского Marius, «принадлежащий богу Марсу» или «мужской»), а в Латвии это ещё и имя морского божества из народных поверий. Окончание -ая в русском языке — типичное для фамилий, которые адаптировали при заселении: его могли добавить, чтобы подогнать иноязычную основу под привычную модель прилагательных (сравните: Боровая, Степная).

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими корнями, где «марис» могло означать «крепкий», «сильный». Однако географическое распространение фамилии (если судить по редким упоминаниям в базах данных) тяготеет к западным регионам России и Беларуси — областям, где исторически были контакты с балтийскими народами. Если предки носителя фамилии были из Псковской или Смоленской губернии, то версия с латышским или эстонским источником становится основной.

Суффикса в привычном русском понимании здесь нет: -ая — это флексия, а не словообразовательный элемент. Фамилия образована по модели «основа + окончание», что для славянской ономастики нехарактерно и указывает на позднюю русификацию. Социальный статус предков установить сложно: фамилия не дворянская и не купеческая, скорее всего, она возникла в крестьянской или мещанской среде, когда при переписи населения писарь записывал прозвище или имя главы семьи на слух, добавляя русское окончание.

Из-за редкости фамилии у неё нет устоявшихся вариантов написания, а в дореволюционных документах её могли фиксировать как Мариса, Марисай или Марисса. Споров среди ономастов по этой фамилии нет — она слишком локальна. Если вы встретили Марисая в своём роду, ищите корни в западных губерниях Российской империи, особенно в местах, где жили латыши или староверы.