Фамилия Маркочев образована от имени или прозвища Маркоч, а тот, в свою очередь, — от крестильного имени Марк. Это имя латинского происхождения, означающее «молот», было популярно в святцах, поэтому дало множество производных форм. В русской народной традиции имя Марк часто сокращали и переделывали: Марко, Маркуша, Маркоч. Суффикс -оч в основе Маркоч указывает на уменьшительно-ласкательное или обиходное звучание — так могли называть в семье или в деревне.

Патронимический суффикс -ев указывает на происхождение от отца: Маркочев буквально значит «сын Маркоча». Это типичная модель для русских фамилий, закрепившихся в XVI–XVII веках, когда прозвище или имя отца переходило к детям как наследственное родовое имя. В отличие от фамилий на -ов, которые образуются от основ на твёрдый согласный, суффикс -ев присоединяется к мягким или шипящим основам (как в случае с -ч).

Географически фамилия Маркочев встречается нечасто и преимущественно в центральных и северных регионах России, а также в Поволжье. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми — именно в этих слоях населения фамилии на -ев закрепились в первую очередь. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано, что подтверждает её народное, непривилегированное происхождение.

Стоит обратить внимание на редкий вариант написания — Маркочев, а не Маркачев. Второй вариант был бы образован от формы Маркач, но именно мягкое окончание -оч сохранилось в основе, что говорит о конкретном, локальном прозвище. Возможно, в говорах Маркочем называли человека, чем-то напоминавшего «марка» — например, носившего тёмные или меченые пятна на одежде (от диалектного «маркий» — пачкающийся), но более вероятна связь с именем, так как прозвища от качеств реже становились полноценными фамилиями в таком суффиксальном оформлении.