Фамилия Машицына — редкий пример, где женская форма закрепилась как основная в написании, хотя по происхождению это, скорее всего, вариант фамилии Машицын. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я. Исходная основа здесь — Машица. Что стоит за этим словом?

Самое прямое объяснение — прозвище или имя Машица. Это уменьшительная форма от канонического имени Матвей (через народное Матюша, Маша) или от Мария. В северных и центральных говорах «машицей» могли называть человека небольшого роста, юркого или суетливого — от диалектного «машить» (махать, делать быстрые движения). Встречается и значение «маленькая мошка, букашка», что давало прозвище невысокому или хлопотливому человеку.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с профессией. В псковских и тверских говорах «машица» — это деревянная колотушка, которой утрамбовывали землю или забивали колья. Такое орудие труда давало прозвище плотнику или строителю. Однако эта версия уступает антропонимической: подавляющее большинство русских фамилий на -ин образовано от личных имён и прозвищ, а не от названий предметов.

Фамилия редкая, её географическое ядро — центральные области России, особенно Тверская и Московская губернии, где диалектное слово «машица» было в ходу. Встречается и на Украине, но там форма Машицын/Машицына могла возникнуть независимо от украинского «машиця» (маленький мак).

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Машицын, то есть сын или потомок человека по прозвищу Машица. Женская форма Машицына в документах стала фиксироваться как самостоятельная фамилия в XIX веке, когда жёны и вдовы получали паспорта на фамилию мужа, и в некоторых семьях закрепилось именно такое написание.