Фамилия Машына — редкий пример того, как написание может оказаться важнее произношения. В русском языке после шипящих под ударением пишется «о», а без ударения — «е»: «машина». Вариант через «ы» — Машына — выдаёт в фамилии нерусское происхождение, скорее всего, белорусское или западнорусское, где твёрдое «ы» в суффиксе — норма. В белорусском языке слово «машына» (через «ы») означает то же самое — машина, механизм, но фамилия возникла не от автомобиля, а от прозвища.

Основа фамилии — «машына» в значении «машинист», «механик» или «человек, работающий с механизмами». В XIX веке так могли назвать железнодорожника, паровозного машиниста, рабочего на заводе или даже того, кто управлял первыми сельскохозяйственными машинами — молотилками, веялками. Прозвище давали по профессии, и оно закрепилось за одним человеком, а затем перешло к его потомкам как фамилия. Суффикс -а в основе — типичное для белорусских и украинских фамилий окончание женского рода, но сама фамилия могла принадлежать и мужчине, и женщине: в форме «Машына» она не склонялась по роду носителя, в отличие от русских фамилий на -ин.

Географически фамилия Машына встречается преимущественно в Беларуси (особенно в Витебской и Могилёвской областях) и в западных регионах России, граничащих с Беларусью — Смоленской, Брянской, Псковской. В центральной России и на юге она редка, что подтверждает её западнорусский ареал.

Версия о происхождении от имени Маша (уменьшительное от Мария) с суффиксом -ин маловероятна: тогда фамилия писалась бы «Машин» (с ударением на первый слог) и не имела бы твёрдого «ы». Написание через «ы» однозначно указывает на белорусскую фонетику, где «ы» — обычный звук, а не орфографическая ошибка.

Таким образом, фамилия Машына — профессиональное прозвище машиниста или механика, закрепившееся в белорусской языковой среде. Её носители — скорее всего, потомки первых железнодорожников или заводских рабочих конца XIX — начала XX века.