Фамилия Матезиус — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение лежит не в крестьянской среде, а в академической или духовной. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин или -ский, Матезиус имеет латинизированную форму, что сразу указывает на книжное, искусственное происхождение.

В основе фамилии лежит латинское имя Matthias (Матфий), которое восходит к древнееврейскому «Маттитьягу» — «дар Яхве». В русской традиции это имя дало формы Матвей и Матфей. Суффикс -ius в латинском языке — типичное окончание для мужских имён и фамилий в научной и церковной латыни. Таким образом, Матезиус — это латинизированный вариант фамилии, образованной от имени Матвей.

Наиболее вероятная среда возникновения — духовные училища и семинарии. В XVIII–XIX веках, при поступлении в семинарию, детям духовенства часто меняли фамилии на более благозвучные или «учёные» — греческие или латинские. Так появились целые пласты фамилий вроде Сперанский (от лат. spero — «надеюсь»), Бенедиктов, Аполлосов. Матезиус — прямая аналогия: будущий священник или учитель получал фамилию по своему имени, но в латинской огласовке, что звучало престижно для того времени.

Географически фамилия могла закрепиться в западных губерниях Российской империи, особенно на территориях, входивших в Речь Посполитую (современные Беларусь, Украина, Литва), где латинский язык был распространён в католическом образовании. Однако Матезиус встречается и у православных — это говорит о том, что семинарская мода на латынь была всеобщей.

Примечательно, что в немецком и чешском языках существует фамилия Mathesius (Матезиус) — например, известный чешский лингвист Вилем Матезиус. Но в русском контексте эта фамилия, скорее всего, не имеет прямого западного корня, а возникла самостоятельно по той же модели. Если носитель фамилии — русский, его предок почти наверняка был либо семинаристом, либо получил фамилию от священника при крещении.

Таким образом, Матезиус — не прозвище по ремеслу или внешности, а искусственная книжная фамилия, которая в XIX веке звучала как признак образованности и принадлежности к духовному сословию.