Фамилия Мацора — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. В ней нет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает на более позднее или иноязычное оформление. Скорее всего, перед нами украинская или белорусская фамилия, образованная по модели прозвищ на -ора (ср. Мазура, Ковтун, Шинкарь). Ударение обычно падает на второй слог: Мацо́ра.

Самая вероятная версия связывает основу «Мац-» с украинским или польским глаголом «мацати» — щупать, трогать. В таком случае Мацора — прозвище человека, который всё трогал руками, возможно, чрезмерно любопытного или тактильного. В говорах западных областей «мац» могло означать и «ощупь», «ладонь». Вторая версия, менее распространённая, отводит эту фамилию к уменьшительной форме имени Матвей (Мацей, Мацьо) с суффиксом -ора. То есть Мацора — это «сын Мацея» или просто Матвей в пренебрежительно-ласкательном звучании.

Географически фамилия встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в юго-восточной Польше. В России она крайне редка и, как правило, принадлежит потомкам переселенцев из этих регионов. В польском языке существует однокоренная фамилия Maciora, которая может относиться к тому же корню «мацать» или к диалектному слову «maciora» — свиноматка, но для русского уха это звучит грубовато и вряд ли было основой для прозвища.

Таким образом, предок носителя фамилии Мацора — скорее всего, человек с характерной привычкой или прозвищем, живший на украинско-польском пограничье. Сословной привязки у фамилии нет: её могли получить и крестьяне, и мещане. В дореволюционных метриках она почти не фиксируется, что подтверждает её локальный и поздний характер.