Фамилия Матьора — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она напоминает диалектное или искажённое слово, но разбор по частям даёт несколько версий, каждая из которых ведёт к разным занятиям предков.

Основа фамилии — «матьор» или «матьора». Самый прямой путь — к прилагательному «матерый», которое в старых говорах имело значение «взрослый, зрелый, опытный», а также «крепкий, здоровый, сильный». В северных и сибирских диалектах слово «матерый» нередко произносили как «матьорый» — с твёрдым «р» и без смягчения. Прозвище Матьора могли дать рослому, крепкому мужчине или человеку, который прожил долгую, полную событий жизнь. Фамилия образована по модели, типичной для северных и центральных областей России: от прозвища на -а (Матьора) через притяжательный суффикс -ин — Матьорин, но в данном случае суффикс нулевой, то есть фамилия осталась в форме исходного прозвища. Это встречается у фамилий, застывших в именительном падеже (как Шуя, Ворона, Сорока), но для славянских фамилий такая модель редка и обычно указывает на украинское или белорусское влияние, либо на очень раннюю фиксацию в документах.

Вторая версия отталкивается от слова «мать» — «матка, матушка». В некоторых говорах «матьора» означало «мать семейства», «старшая женщина в доме». Если прозвище дали женщине, фамилия могла перейти к детям по материнской линии (внебрачным или при неполной семье). В таком случае Матьора — аналог фамилии Материн, но без суффикса, что опять же нетипично для русской модели и скорее свойственно западным славянам.

Третья версия — топонимическая. В Тверской и Новгородской областях есть река Матьора (приток Волги) и деревни с похожими названиями. Житель с берегов Матьоры мог получить прозвище по реке, а затем и фамилию. Однако в этом случае чаще встречается форма Матёрин или Матёрский.

Фамилия Матьора почти не встречается в центральных и южных областях России. Основные очаги — Архангельская область, север Удмуртии и Пермский край. Это указывает на поморское или коми-пермяцкое происхождение, где фамилии на -а (без суффикса) более обычны. В переписях XVII–XVIII веков в Поморье фиксируются крестьяне с прозвищем Матёра (Матьора), что подтверждает первую версию.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Матёрин, Матёров, Матёркин. Все они образованы от того же корня «матёр-», но с разными суффиксами. Фамилия Матьора стоит особняком — она сохранила архаичную форму прозвища, не перестроившись под стандартную модель на -ов/-ев. Это делает её ценной для диалектологов: по ней можно судить о живучести местных говоров в фамилиях.

Если говорить о социальном контексте, то носители фамилии Матьора в XIX веке — преимущественно государственные крестьяне Севера, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.