Фамилия Майсаканов — редкий пример, где в основе лежит не имя или ремесло, а топоним, причём не славянский, а тюркский. Корень «Майсакан» — это название села или местности. Такие фамилии, образованные от названия населённого пункта, типичны для народов Северного Кавказа и Закавказья, особенно для осетин, ингушей и чеченцев. Майсакан — это, скорее всего, аул или хутор, от названия которого пошла фамилия её первых носителей. Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: «сын Майсакана» или «из Майсакана». В русской традиции этот суффикс стал стандартным окончанием при русификации фамилий, поэтому исходная форма могла звучать как Майсаканты или Майсаканшвили.

Если копнуть глубже, то само слово «Майсакан» можно разобрать на две части. Первая — «май», что во многих тюркских языках означает «масло» или «жир» (ср. казахское «май»). Вторая — «сакан» или «сакъан», что может быть искажённым вариантом слова со значением «сосуд», «кувшин» или «берег». Таким образом, топоним мог означать «масляный берег» или «место, где держат масло». Это указывает на то, что местность была плодородной, пригодной для скотоводства, или же там был источник масла (например, нефтяной выход). Впрочем, есть и более прозаичная версия: Майсакан мог быть личным прозвищем человека, который торговал маслом или отличался тучностью. Но в контексте кавказских фамилий, где привязка к месту жительства — главный способ идентификации, топонимическая версия выглядит убедительнее.

Модель образования фамилии — типичная для региона: к тюркскому или кавказскому корню добавили русский суффикс. Это произошло в XIX–XX веках, когда горцев активно переписывали в метрические книги. В отличие от фамилий на «-швили» (грузинских) или «-ты» (осетинских), Майсаканов получила «-ов» как знак вхождения в общероссийское административное поле. Носители этой фамилии, скорее всего, были из равнинной или предгорной части Северного Кавказа, где села назывались Майсакан — точное местоположение сегодня установить сложно, так как многие мелкие аулы исчезли в ходе депортаций и переселений.

С точки зрения сословной принадлежности, Майсакановы могли быть как вольными горцами (узденями), так и крестьянами. Фамилия не несёт явных признаков дворянства или княжеского титула — в ней нет характерных для знати окончаний «-дзе» или «-швили». Но это не делает её менее древней: топонимические фамилии на Кавказе часто старше, чем многие русские дворянские роды, просто они не попали в родословные книги. Сравните с однокоренными: Майсаков, Майсаев — они встречаются чаще, но все они восходят к одному корню «майс-» (возможно, искажённое «майса» — «камыш» или «тростник» на некоторых тюркских наречиях). Если так, то предок Майсакановых жил у камышовых зарослей.