Фамилию Мефтохудинов стоит рассматривать как редкий пример сложения двух разных этнокультурных пластов. На первый взгляд, основа «Мефтохуд» звучит как искажённое арабское имя или прозвище, а суффикс «-ов» указывает на русскую модель образования фамилий (чьим будешь? — Мефтохудинов). Однако при детальном разборе выясняется, что перед нами, скорее всего, вариант фамилии Мафтухудинов или Мафтухуддинов, где исходное имя — арабское «Мафтухуддин» (открывающий врата веры). В тюркской и кавказской среде такие имена нередко упрощались: звук «д» в середине мог выпадать, а конечное «-дин» превращалось в «-худ» или «-хут». Таким образом, Мефтохудинов — это русифицированная форма отчества от арабо-мусульманского имени, которое давали мальчикам в семьях, связанных с исламским образованием или духовенством.

Словообразовательная модель здесь стандартна для русского языка: к основе «Мефтохуд» добавили суффикс «-ин» (как в фамилиях от имён на -а/-я: Ильин, Никитин) и затем «-ов» для оформления по мужскому роду. Но в реальном бытовании фамилия закрепилась именно с «-ов», что говорит о позднейшей паспортизации, когда носители уже говорили по-русски и адаптировали фамилию под привычный шаблон. Географически такую фамилию можно встретить среди татар, башкир или народов Дагестана, где в XIX–XX веках шла активная русификация имён и фамилий.

Интересная деталь: в написании «Мефтохудинов» сохранился след диалектного произношения. В арабском оригинале первый гласный — «а» (Мафтух), но в тюркских языках под влиянием губной гармонии он мог перейти в «е» или «и». Поэтому фамилия Мефтохудинов — не ошибка писаря, а живой фонетический вариант, который закрепился в документах. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Мафтухудинов, Мафтухов), то Мефтохудинов выделяется редкостью: она встречается буквально у единичных семей, чаще всего в Поволжье или на Урале.

О дворянском происхождении говорить не приходится — фамилия явно народная, крестьянская или мещанская. Предки носителя, скорее всего, были муллами, учителями при мечети или просто людьми, получившими имя в честь религиозного понятия. После революции многие такие фамилии упрощали, но Мефтохудинов устоялся в исходной форме, сохранив память о своём восточном корне.