Фамилия Мегалинская звучит необычно для русского уха, и это не случайно: её происхождение, скорее всего, не связано напрямую с древнерусскими прозвищами или профессиями. В основе лежит греческое слово «мегас» (μέγας) — «большой», «великий». В русской ономастике фамилии с корнем «мегал-» — редкость, и их появление обычно объясняют влиянием духовного сословия или искусственным книжным образованием.

Суффикс -ск- указывает на типичную модель для фамилий, образованных от географических названий или от прозвищ, оформленных по образцу дворянских. В случае Мегалинской, скорее всего, мы имеем дело с семинарской фамилией. В духовных училищах и академиях XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали «говорящие» фамилии, переведённые на греческий или латынь, чтобы подчеркнуть добродетель, величие или красоту. «Мегалинский» мог означать «великий» или «относящийся к великому» — возможно, в честь какого-то церковного понятия (например, «Великая церковь» — Святая София) или как псевдоним, данный ученику за выдающиеся успехи.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с топонимом. В Польше и на западе Украины встречаются небольшие населённые пункты с похожими названиями (например, Мегалин, Мегаловка), от которых по модели «-ский» могла образоваться фамилия. Однако документальных подтверждений существования такого села, давшего начало именно этой фамилии, нет.

Исконно русских крестьянских фамилий с таким корнем не существует. Если вы встретили Мегалинскую в современных списках, это почти наверняка потомки духовенства или, в редких случаях, семьи, получившие фамилию при переезде из Западного края Российской империи. Окончание -ая в женском роде (Мегалинская) — типичное склонение для фамилий на -ский, не меняющее историю происхождения.