Фамилия Мерисакова — довольно редкая и с запутанной этимологией. С первого взгляда в ней угадывается иноязычная основа, но при детальном разборе выясняется, что корни могут быть как тюркскими, так и финно-угорскими, а в некоторых случаях — чисто русскими, просто с необычным суффиксом.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна. Суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей?»), но основа «Мерисак» не имеет прямых аналогов в славянских именах. Самая вероятная версия — фамилия происходит от прозвища или имени Мерисак, которое могло сложиться из двух частей. В тюркских языках (например, татарском, башкирском) «мер» или «мир» означает «мир, вселенная», а «сак» — «осторожный, бережливый» или же «сак» как этноним (племя саков). Таким образом, Мерисак могло означать «мирный сак» или «мудрый хранитель». Эта версия подкрепляется тем, что фамилии с компонентом «сак» встречаются в Поволжье и на Урале, где исторически смешивались славянские и тюркские народы.

Вторая гипотеза связана с финно-угорским субстратом, характерным для севера европейской части России. В коми-зырянском языке есть слово «мер» (ягода, морошка) и «сак» (снег, иней). Прозвище Мерисак могли дать человеку, родившемуся в снежное время, когда поспевала морошка, что звучит поэтично, но маловероятно для устойчивого прозвища. Более правдоподобно, что Мерисак — это искажённое местное имя или фамилия, записанная русскими писцами на слух, например, от карельского или вепсского корня.

Третья, менее экзотическая версия — фамилия могла возникнуть на русской почве от редкого прозвища «Мерисак», которое образовано от глагола «мерить» и слова «сак» (рыболовная сеть, мешок). Так могли прозвать рыбака, который мерил сети, или человека, который «мерил саки» (то есть отмерял мешки с зерном). Эта версия объясняет фамилию без привлечения иностранных языков, но оставляет открытым вопрос, почему прозвище закрепилось именно в такой громоздкой форме.

Географически фамилия Мерисакова встречается крайне редко, единичные записи фиксируются в Башкортостане, Татарстане и на юге Урала. Это подтверждает первую, тюркскую гипотезу, как наиболее вероятную. Сословно носители фамилии, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами, возможно, из числа крещёных татар или башкир, перешедших в православие и получивших фамилию по отцу. Однозначного ответа на вопрос о происхождении нет, но тюркский след выглядит убедительнее других.