Фамилия Мерсагатов образована от имени Мерсагат, которое является вариантом тюркского имени Мирзагат, состоящего из двух основ. Так, первая часть этого имени восходит к слову «мирза» («мурза»), которое в переводе с тюркского означает «знатный», «принц». Слово «мурза» в старину в тюркских государствах означало аристократический титул. Однако позднее оно стало активно использоваться в качестве одного из компонентов тюркских личных имен. В основе второй части имени Мирзагат лежит татарское имя Агат означает «драгоценный камень; халцедон». В старину у многих народов были распространены имена, образованные от названий драгоценных камней. Агат высоко ценится с античных времен. Издревле считалось, что этот камень приносит удачу его владельцу и символизирует такие качества, как стойкость, удачливость и любовные победы. Также агату приписывается способность оберегать человека от оружия.